创新网络中主体的合作与资源共享必然伴随着知识转移，合作主体的选择是知识转移活动必须要考虑的问题．通过深入分析创新网络中知识转移主体合作的影响因素，提出了知识转移主体合作的评价指标体系．并在此基础上，利用多目标优化决策理论，建立了主体合作的定量决策模型．即使在知识转移主体特征变化较大的情况下，模型还能综合考虑各种因素对决策的影响，给出合理的最佳的主题选择方案．另外，模型能对优选方案进行排队，能为决策者提供丰富的决策支持信息．